新西兰高级生物信息学家Cecilia Deng来校交流访问

(文本≈园艺与林业学院通讯员田静)由新西兰皇家科学院中国科技部科技交流中心任命,新西兰皇家植物与食品研究所高级生物信息学专家塞西莉亚邓红(Cecilia)来到学校进行为期三周的交流访问。10月30日下午,塞西莉亚在分子楼118圆桌会议室发表了题为“西梨基因组学”的学术报告,11月6日下午,她为柑橘品质研究小组的师生举办了一个关于r语言在基因表达差异分析中的应用的学习班。

在报告中,塞西莉亚介绍了新西兰皇家植物与食品研究所的概况和主要研究工作,展示了梨、苹果、猕猴桃、柑橘、真菌(梨黑星病、苹果黑星病和枇杷黑星病的病原菌)和细菌的基因组学和转录组学研究,展示了通过生物信息学分析获得的西洋梨、日本梨和苹果基因组的同源性和差异性。之后,她介绍了一些新的技术和原理,如基于酶消化的简化基因组测序技术,并与教师和学生深入讨论了测序实验的设计和测序片段大小的分析。

11月6日下午,塞西莉亚带领大家用Rstudio编程R语言来分析基因表达数据。细心的塞西莉亚预先为每个人准备了PDF教程,耐心地回答学生的谜题。

访问期间,园艺与林业学院的徐娟教授和生命科学与技术学院的陈春丽副教授分别与塞西莉亚就双方感兴趣的话题交换了意见,并与塞西莉亚就柑橘品质形成的相关研究达成了合作协议。

塞西莉亚邓红,新西兰植物与食品研究所高级生物信息学专家。主要研究领域包括梨、苹果、猕猴桃、橙子、真菌和细菌基因组学和转录组学的生物信息学研究。目前,塞西莉亚的研究工作包括大规模项目,如西洋梨(Pyrus bretschneideri)、猕猴桃和苹果的基因组测序和组装,蔷薇科苹果亚科的SNP-CHIP设计和生产。